RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358161.9

SPTAN1-201, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-201ENST00000358161 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TUBG1P23258 451 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 SHOXO15266 292 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 B4GALT3O60512 393 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 BSGP35613 385 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ARR3P36575 388 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GFERP55789 205 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TEX37Q96LM6 180 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CHST8Q9H2A9 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TSPAN11A1L157 253 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TMPRSS11DO60235 418 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PNLIPRP2P54317 469 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 THEM4Q5T1C6 240 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR7G2Q8NG99 324 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 UBQLN3Q9H347 655 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TOR1AO14656 332 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PIP5K1CO60331 668 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 HLA-DMAP28067 261 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 FCRL6Q6DN72 434 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GHSRQ92847 366 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TMEM106AQ96A25 262 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 RASD2Q96D21 266 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 SGCEO43556 437 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 UBBP0CG47 229 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TRIM23P36406 574 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 VEGFCP49767 419 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 IL11RAQ14626 422 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 MEP1BQ16820 701 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TIMD4Q96H15 378 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 FKRPQ9H9S5 495 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PROCRQ9UNN8 238 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 HMX2A2RU54 273 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 F2RL1P55085 397 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TAAR8Q969N4 342 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GNG12Q9UBI6 72 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 MPLP40238 635 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 MTNR1BP49286 362 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GPR85P60893 370 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CD163Q86VB7 1156 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 EXD3Q8N9H8 876 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 C8orf44Q96CB5 159 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 MRGPRX4Q96LA9 322 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 RGS11O94810 467 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PTGER4P35408 488 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ETV5P41161 510 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 BORCS7Q96B45 105 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CD300AQ9UGN4 299 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 M0R082 166 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ICOSLGO75144 302 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 CPT2P23786 658 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TNK1Q13470 666 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ABHD4Q8TB40 342 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 LIPHQ8WWY8 451 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TSLPQ969D9 159 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 ACOD1A6NK06 481 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 TNFRSF10AO00220 468 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-201ENST00000358161 P2RY10O00398 339 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms