RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FANCMQ8IYD8 2048 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JMM0 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPB8 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRS3 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS8O00214 317 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SGCEO43556 437 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DOK2O60496 412 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF432O94892 652 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN19P0C672 248 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ETS2P15036 469 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCL8P80075 99 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 Q5PR19 223 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TESCQ96BS2 214 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 APOL4Q9BPW4 351 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF1Q9NS23 344 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DAPL1A0PJW8 107 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-2O95096 273 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RAF1P04049 648 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CRHP06850 196 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ACADSP16219 412 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 S1PR1P21453 382 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GABRR1P24046 479 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LCN1P31025 176 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K8P41279 467 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR8G1Q15617 311 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LTC4SQ16873 150 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF385BQ569K4 471 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 UBE3DQ7Z6J8 389 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KLBQ86Z14 1044 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CHST4Q8NCG5 386 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC8Q8TC99 324 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2H4Q92759 462 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NRBF2Q96F24 287 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 Q96MT0 163 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR10A2Q9H208 303 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FN3KQ9H479 309 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 POLE3Q9NRF9 147 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 VAPAQ9P0L0 249 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 POMPQ9Y244 141 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf142B7Z368 130 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCRL2O00421 344 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF205O95201 554 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LYNP07948 512 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DBHP09172 617 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TACSTD2P09758 323 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR12D2P58182 307 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RFX4Q33E94 735 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 COQ5Q5HYK3 327 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 AVPI1Q5T686 147 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 WDR76Q9H967 626 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms