RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MDGA2Q7Z553 956 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ASB10Q8WXI3 467 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 NTNG2Q96CW9 530 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 SMIM19Q96E16 107 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TXNDC15Q96J42 360 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 INTS14Q96SY0 518 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 MED29Q9NX70 200 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 WDFY2Q96P53 400 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 FREM3P0C091 2139 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 SNX4O95219 450 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 LIFP15018 202 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 ZBTB8AQ96BR9 441 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 POLE4Q9NR33 117 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WV48 116 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPK0 400 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 A6NIZ1 184 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF15O95150 251 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 SERPINA7P05543 415 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ADH6P28332 368 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 RAP1BP61224 184 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.161e-9■□□□□ 9
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ACTB-201ENST00000331789 CSRP2Q16527 193 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 AP3S1Q92572 193 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 AMELYQ99218 206 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 MROQ9BYG7 248 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 V9GYH0 126 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WZY1 265 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ZIC3O60481 467 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 UPK3AO75631 287 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ABHD16AO95870 558 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 CD1AP06126 327 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TACSTD2P09758 323 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 OCM2P0CE71 109 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 PSMD7P51665 324 aa16.03■□□□□ 0.16
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