RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 AFMIDQ63HM1 303 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 BTNL8Q6UX41 500 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SPICQ8N5J4 248 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GABARAPL3Q9BY60 117 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 XKRY2A2RUG3 117 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 HHLA1C9JL84 531 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK5O95279 499 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 EPHA1P21709 976 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GNG10P50151 68 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 RAB7AP51149 207 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 MTURNQ8N3F0 131 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NUP43Q8NFH3 380 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 APIPQ96GX9 242 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GPR137Q96N19 417 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GPR87Q9BY21 358 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQU0 124 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 FAM72CH0Y354 149 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TBPL1P62380 186 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 PTPRCAPQ14761 206 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 FAM72BQ86X60 149 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 UCK1Q9HA47 277 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK12Q9HB15 430 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PPH5 198 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 FAM166BA8MTA8 275 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM11O75078 769 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINE2P07093 398 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SULT1A2P50226 295 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN12P56749 244 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 PMS2P11Q13670 270 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 HAGHQ16775 308 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT16Q8N428 558 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 DPH1Q9BZG8 443 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 EHFQ9NZC4 300 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 LEMD1Q68G75 181 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZTK2 550 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 OR8U1Q8NH10 309 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 AK3Q9UIJ7 227 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 GPR34Q9UPC5 381 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NDUFS8O00217 210 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 B4GALT2O60909 372 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 MMP2P08253 660 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SDC1P18827 310 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TM4SF4P48230 202 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 C19orf35Q6ZS72 473 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 OVCH1Q7RTY7 1134 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 C4BP0C0L5 1744 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 K7ERQ8 282 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 HCRTO43612 131 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CHRM4P08173 479 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 C8orf89P0DMQ9 161 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 IL1RNP18510 177 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 HYAL2Q12891 473 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 HTR3DQ70Z44 454 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ACAD8Q9UKU7 415 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ITGB7P26010 798 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN31Q12999 210 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 TCRBV5S2A0A599 114 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 M0QYG6 137 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 NTF3P20783 257 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 MMP11P24347 488 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 CRABP1P29762 137 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SIRPAP78324 504 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 SLC7A9P82251 487 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 DOC2AQ14183 400 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 LIPNQ5VXI9 398 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF765Q7L2R6 523 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms