RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262304.8

PKD1-201, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1, Length 14,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-201ENST00000262304 RAD52P43351 418 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 BANF2Q9H503 90 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PKDCCQ504Y2 493 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF691Q5VV52 312 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 BTBD17A6NE02 478 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GPR171O14626 319 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 UGDHO60701 494 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 DMWDQ09019 674 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 IGSF8Q969P0 613 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RAB3CQ96E17 227 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ADOQ96SZ5 270 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CSF2RAP15509 400 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF30P17039 623 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CNR1P21554 472 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SHC1P29353 583 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PCGF2P35227 344 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GDNFP39905 211 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CAMK2BQ13554 666 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GPR18Q14330 331 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TMEM64Q6YI46 380 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 C17orf105B2RV13 164 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FUCA1P04066 466 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LCN8Q6JVE9 175 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 DYRK2Q92630 601 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SMOQ99835 787 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 NDUFB2O95178 105 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LGI1O95970 557 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GPR85P60893 370 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LMAN2Q12907 356 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SERINC5Q86VE9 423 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ASB13Q8WXK3 278 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 DPP4P27487 766 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TAS2R46P59540 309 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SBK2P0C263 348 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HSD17B7P56937 341 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RBPJQ06330 500 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MED13Q9UHV7 2174 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 B4GALT3O60512 393 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PTHP01270 115 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SNCAP37840 140 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FAM122BQ7Z309 247 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PDZD3Q86UT5 571 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HS3ST1O14792 307 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SYT9Q86SS6 491 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF573Q86YE8 665 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 C1orf198Q9H425 327 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 AK3Q9UIJ7 227 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR2M5A3KFT3 312 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR7G3Q8NG95 312 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PCYT2Q99447 389 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 BMP2P12643 396 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC5A2P31639 672 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CLDN2P57739 230 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ELOCQ15369 112 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HACD4Q5VWC8 232 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GPR119Q8TDV5 335 aa9.46□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 HCCSP53701 268 aa9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 BADQ92934 168 aa9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 ARSGQ96EG1 525 aa9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 MED30Q96HR3 178 aa9.46□□□□□ -0.9
PKD1-201ENST00000262304 ZNF778Q96MU6 729 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms