RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ8AQ8NI60 647 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP25Q9NPA2 562 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPB2A8KAH6 182 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF35P13682 527 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ALOX5APP20292 161 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPB2Q16082 182 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NNATQ16517 81 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB13Q8WXK3 278 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM106AQ96A25 262 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR76Q9H967 626 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CTSBP07858 339 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4D10Q8NGI6 311 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL6Q9H0F7 186 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM60AQ9NP50 221 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 H0YC42 278 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GPM6BQ13491 265 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GLS2Q9UI32 602 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 EML5Q05BV3 1969 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 AQP8O94778 261 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAIN1P0CW23 69 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ADH7P40394 386 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 EFNB2P52799 333 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1CAP62136 330 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TVP23AA6NH52 213 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 GOSR2O14653 212 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 AKR7A3O95154 331 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 RLN1P04808 185 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 FUT7Q11130 342 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MESTQ5EB52 335 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN4O14817 238 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB2P14652 356 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 EGR4Q05215 589 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT77Q7Z794 578 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BIVMQ86UB2 503 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BVESQ8NE79 360 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ST8SIA4Q92187 359 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 THRSPQ92748 146 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DGAT2Q96PD7 388 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 LPAR4Q99677 370 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10A5Q9H207 317 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 F13BP05160 661 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 GMFBP60983 142 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BTN1A1Q13410 526 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TSSK4Q6SA08 328 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51S1Q8NGJ8 323 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf45Q96LM5 186 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 APMAPQ9HDC9 416 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BLACEA4D250 179 aa20.06■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms