RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PLSCR5A0PG75 271 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TNFRSF10AO00220 468 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RAF1P04049 648 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO45P0C2W1 286 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 FCGR2AP12318 317 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 IL32P24001 234 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 S100PP25815 95 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MAP2K6P52564 334 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 DLX5P56178 289 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35A2P78381 396 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RELAQ04206 551 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TSSK4Q6SA08 328 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC18Q8N456 261 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NPRL2Q8WTW4 380 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GAB3Q8WWW8 586 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGDIGQ99819 225 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GABRG3Q99928 467 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LRP5LA4QPB2 252 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ATP1B1P05026 303 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CAMLGP49069 296 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SELENBP1Q13228 472 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RLIMQ9NVW2 624 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SOD1P00441 154 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ST6GAL1P15907 406 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GABRG2P18507 467 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SRMP19623 302 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TCN2P20062 427 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GIFP27352 417 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 S100A2P29034 98 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 THEM4Q5T1C6 240 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 STK35Q8TDR2 534 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PIGCQ92535 297 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MUCL1Q96DR8 90 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 UPK1AO00322 258 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GAAP10253 952 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ABOP16442 354 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RAP2BP61225 183 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SRPXP78539 464 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 IL13RA1P78552 427 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MFAP5Q13361 173 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 APOOLQ6UXV4 268 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 DOK3Q7L591 496 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD7Q86VX2 200 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SYS1Q8N2H4 156 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR1S1Q8NH92 325 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MIB2Q96AX9 1013 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TEAD3Q99594 435 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 WNT16Q9UBV4 365 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SIPA1L1O43166 1804 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LMO7DNF2Z398 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SURF4O15260 269 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ETHE1O95571 254 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 KNG1P01042 644 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINE2P07093 398 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 HTR2BP41595 481 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CX3CR1P49238 355 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 FXYD4P59646 89 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 IL10RAQ13651 578 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.93□□□□□ -1.46
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