RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 RASD2Q96D21 266 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TXNDC15Q96J42 360 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF570Q96NI8 536 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MBOAT4Q96T53 435 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EMC6Q9BV81 110 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 VCX3BQ9H321 246 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TOR3AQ9H497 397 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf49Q9H741 205 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GP6Q9HCN6 339 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf4Q9NR00 106 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 Q9UFV3 132 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GUH1 482 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35F4A4IF30 521 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF726A6NNF4 738 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB2A8KAH6 182 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BHLHE40O14503 412 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BCL10O95999 233 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IGHMP01871 453 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CTSSP25774 331 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EPHA2P29317 976 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SDHAP31040 664 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NTF4P34130 210 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ACVR1BP36896 505 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOPP49908 381 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SMSP52788 366 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MYBPC1Q00872 1141 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NPRL3Q12980 569 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CAMK2DQ13557 499 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GINS1Q14691 196 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GUSBP1Q15486 140 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB2Q16082 182 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PGGHGQ32M88 737 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf17Q53FE4 359 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CARD17Q5XLA6 110 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 VWA1Q6PCB0 445 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FAM122BQ7Z309 247 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RND1Q92730 232 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM45BQ96B21 275 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 Q96M85 177 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR2M2Q96R28 347 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 A6NIZ1 184 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZAR1LA6NP61 321 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 H7C1C5 153 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 DLGAP1O14490 977 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 XKRYO14609 159 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IMPA2O14732 288 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC3O15145 178 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ST8SIA5O15466 376 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGEF9O43307 516 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC43A1O75387 559 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TNFSF13O75888 250 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-9P01782 118 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IGHG1P01857 330 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CRHP06850 196 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ACADSP16219 412 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BMP5P22003 454 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EDNRAP25101 427 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GRK5P34947 590 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OPRM1P35372 400 aa7.54□□□□□ -1.2
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