RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 RASSF2P50749 326 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 CLRN1P58418 232 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 PRPS1P60891 318 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 MS4A2Q01362 244 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 CHRNB3Q05901 458 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 BNIP1Q12981 228 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 FLOT2Q14254 428 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 OR51A7Q8NH64 312 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 ASB10Q8WXI3 467 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 ZNF566Q969W8 418 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 LRR1Q96L50 414 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 GPR35Q9HC97 309 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 EDARQ9UNE0 448 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 AURKCQ9UQB9 309 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-214ENST00000625905 ITPR2Q14571 2701 aa8.09□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ABCA4P78363 2273 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 POLQO75417 2590 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 A0A096LPE4 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PPR1 153 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PPZ6 126 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 M0R1B8 84 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 CDC42EP2O14613 210 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ACOT8O14734 319 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 OR10H3O60404 316 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ATP5HO75947 161 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 SEC14L2O76054 403 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 WNT11O96014 354 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TSPAN19P0C672 248 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PGA4P0DJD7 388 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PGA3P0DJD8 388 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NR2C1P13056 603 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 IFNGR2P38484 337 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 MAGEA2P43356 314 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 OMPP47874 163 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 LIMS1P48059 325 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ZNF83P51522 516 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 BSPH1Q075Z2 132 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 SEC23BQ15437 767 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TAF11Q15544 211 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ACKR1Q16570 336 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NINJ1Q92982 152 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 APCP25054 2843 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 DHRS12A0PJE2 317 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 AQP12BA6NM10 295 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 CENPBD1B2RD01 187 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ABCD4O14678 606 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-214ENST00000625905 ENTPD5O75356 428 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms