RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ACHEP22303 614 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GIPRP48546 466 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52B2Q96RD2 323 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TREM2Q9NZC2 230 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf58C9J3I9 102 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TPST1O60507 370 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NCR1O76036 304 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ETS2P15036 469 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 FADDQ13158 208 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK2DQ13557 499 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ULK3Q6PHR2 472 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf111Q8N326 155 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKBIDQ8NI38 313 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MOGAT1Q96PD6 335 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXB1Q99853 325 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ULBP2Q9BZM5 246 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN3E7EW58 273 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB36O95755 333 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TFP02787 698 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GAAP10253 952 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT2P11245 290 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB1AP62820 205 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAIQ8N9R8 606 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6N1Q8NGY5 312 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6S1Q8NH40 331 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF217Q8TC41 542 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPNQ9BXN1 380 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB21Q9UL25 225 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 UBDO15205 165 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 WIPF1O43516 503 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS23P62266 143 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GALK2Q01415 458 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PUDPQ08623 228 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB39AQ14964 217 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 THSD4Q6ZMP0 1018 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MIER2Q8N344 545 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MGARPQ8TDB4 240 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP13Q9UII6 198 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RP2O75695 350 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PATE4P0C8F1 98 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ARAFP10398 606 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P3Q13401 168 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 REP15Q6BDI9 236 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51F2Q8NH61 342 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFBP3Q8TAT2 258 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 EPYCQ99645 322 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0B4J2E0 115 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GX12 115 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPW3 197 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM120BA0PK00 339 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF726A6NNF4 738 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIHO43447 177 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TPST2O60704 377 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINI2O75830 405 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 UBL3O95164 117 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM33P57088 247 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NCALDP61601 193 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO4P61968 165 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTG1P63261 375 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1Q1Q15612 314 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP3O14495 311 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 AHCYP23526 432 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB1P43366 347 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK6Q00534 326 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PXKQ7Z7A4 578 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX32Q86XE0 403 aa21.95■■□□□ 1.1
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