RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SGCDQ92629 289 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 RNFT2Q96EX2 444 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TEAD3Q99594 435 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 HCAR1Q9BXC0 346 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SRXN1Q9BYN0 137 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MED20Q9H944 212 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MOKQ9UQ07 419 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GVC2 190 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS37A4D1T9 235 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF814B7Z6K7 855 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF9O43307 516 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL13O43927 109 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TFAP2AP05549 437 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CPN1P15169 458 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 POU4F2Q12837 409 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL12Q53G59 568 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 GPAT4Q86UL3 456 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM80Q96HE8 168 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51V1Q9H2C8 321 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPGQ9Y5X9 500 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FRYQ5TBA9 3013 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YC42 278 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FADS2O95864 444 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DCKP27707 260 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 RNLSQ5VYX0 342 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T4Q8NH00 348 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CDCA4Q9BXL8 241 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2RP11717 2491 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPBD1B2RD01 187 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYABP02511 175 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-ND2P03891 347 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 STSP08842 583 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SPI1P17947 270 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPAP49450 140 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS7P62081 194 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PON3Q15166 354 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 EXD3Q8N9H8 876 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS12Q96DT0 336 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP7Q9Y680 259 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1GO43497 2377 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC182A6NF36 153 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EM74 188 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB36O95755 333 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 MELKQ14680 651 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC17A1Q14916 467 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD8Q6ZWB6 473 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6X1Q8NH79 312 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC8Q8TC99 324 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG12Q9BV10 488 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PLSCR2Q9NRY7 297 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPA2E9PIF3 369 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPA3F8WFD2 350 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP7O14520 342 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGFQ07326 219 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GGTLC2Q14390 218 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SIAH3Q8IW03 269 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52I1Q8NGK6 324 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 UCN2Q96RP3 112 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK17Q96T54 332 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMP4Q99727 224 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB6Q9NWX5 421 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 LHX6Q9UPM6 363 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RAMP1O60894 148 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GLCEO94923 617 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2C1P13056 603 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CRABP1P29762 137 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 BLVRAP53004 296 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A1P53985 500 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 BIDP55957 195 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB3L2Q70SY1 520 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 POMGNT2Q8NAT1 580 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9K2Q8NGE7 335 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ZPLD1Q8TCW7 415 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR1BQ92637 280 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR6Q96RI8 345 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 JAM3Q9BX67 310 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT4Q9H2B2 425 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms