RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 EMC6Q9BV81 110 aa18.53■□□□□ 0.56
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CAPNS1-205ENST00000588780 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-205ENST00000588780 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-205ENST00000588780 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.53■□□□□ 0.56
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CAPNS1-205ENST00000588780 MMP26Q9NRE1 261 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF224Q9NZL3 707 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDN34H7C241 214 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 SPRY3O43610 288 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-205ENST00000588780 SHBGP04278 402 aa18.47■□□□□ 0.55
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