RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A0B4J293	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	AP3B1	O00203	1094 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TXNL1	O43396	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PLPP2	O43688	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TSPAN2	O60636	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	VAPB	O95292	243 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MPZL1	O95297	269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	NTN1	O95631	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GUCA1C	O95843	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	S1PR1	P21453	382 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	NT5E	P21589	574 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	NMBR	P28336	390 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GRIA1	P42261	906 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIC	P45877	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ARFIP1	P53367	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PROK1	P58294	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ICAM4	Q14773	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	NNAT	Q16517	81 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR180	Q86V85	440 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	DSN1	Q9H410	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPP6C	O00743	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	VCY	O14598	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TNFSF11	O14788	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	RGS14	O43566	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ERLIN1	O75477	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	RAD51D	O75771	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	CRYBA1	P05813	215 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	OR4A8	P0C604	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	EVI2B	P34910	448 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	FDFT1	P37268	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC1A3	P43003	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SSR2	P43308	183 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	HNMT	P50135	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM33	P57088	247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	MYL5	Q02045	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRIM25-208	ENST00000574234	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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