RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 AASSQ9UDR5 926 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 C17orf51A8MQB3 221 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 STMND1H3BQB6 276 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ADAM10O14672 748 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 KLF4O43474 513 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 HCRTR2O43614 444 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 GADD45AP24522 165 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 LIPAP38571 399 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 GABREP78334 506 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 TMEM68Q96MH6 324 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RASL10BQ96S79 203 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.07■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FAM186AA6NE01 2351 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 A0A1W2PPL8 197 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MASP2O00187 686 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FPR3P25089 353 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 KIR2DL3P43628 341 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 GPR4P46093 362 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SLC6A19Q695T7 634 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 PFN4Q8NHR9 129 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RASSF1Q9NS23 344 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ITGA10O75578 1167 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 C3orf49Q96BT1 292 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ZNF524Q96C55 264 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MND1Q9BWT6 205 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 OR51M1Q9H341 326 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MED31Q9Y3C7 131 aa16.06■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SLC43A1O75387 559 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FBXO45P0C2W1 286 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 TEX30Q5JUR7 227 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 OR5M11Q96RB7 305 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FAM117AQ9C073 453 aa16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 A0A087WUJ7 227 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 CDC42EP2O14613 210 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SLC6A8P48029 635 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 IL10RAQ13651 578 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ZNF79Q15937 498 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 NTRK2Q16620 822 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RNF138Q8WVD3 245 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SGCEO43556 437 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 GMFGO60234 142 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 HPP00738 406 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MAKP20794 623 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MST1P26927 711 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 ITPKBP27987 946 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 CDC42P60953 191 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 HSF2Q03933 536 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 FGL1Q08830 312 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MISPQ8IVT2 679 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 APH1BQ8WW43 257 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 NKD1Q969G9 470 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 RBP7Q96R05 134 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 DPH1Q9BZG8 443 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MLXQ9UH92 298 aa16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.03■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 M0R082 166 aa16.03■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GDE1-203ENST00000564172 S100A8P05109 93 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms