RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 HTRA1Q92743 480 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 TPD52L3Q96J77 140 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 REG4Q9BYZ8 158 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD1-208ENST00000555806 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.02■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 OR5F1O95221 314 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 IGKV3-15P01624 115 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 IGLV1-44P01699 117 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CELA3BP08861 270 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CBR1P16152 277 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 KDELR2P33947 212 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MELKQ14680 651 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MDP1Q86V88 176 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 FAM169BQ8N8A8 192 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CMTM6Q9NX76 183 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 H7C417 338 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ATP8B1O43520 1251 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ASAH2BP0C7U1 165 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CD79AP11912 226 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 B4GALT1P15291 398 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 PCSK6P29122 969 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CALCRP30988 508 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ARR3P36575 388 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 UGT2B15P54855 530 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZP4Q12836 540 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 OR4F15Q8NGB8 312 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 PFN4Q8NHR9 129 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM255BQ8WV15 326 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 RHNO1Q9BSD3 238 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CA10Q9NS85 328 aa16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 GSTA4O15217 222 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 HLA-HP01893 362 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MT-ND1P03886 318 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLC7A2P52569 658 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 LIPEQ05469 1076 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SPATA21Q7Z572 469 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 OR6X1Q8NH79 312 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM239Q8WW34 195 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 LZICQ8WZA0 190 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF566Q969W8 418 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SGTBQ96EQ0 304 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 FOXB1Q99853 325 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 FAM107BQ9H098 131 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MCIDASD6RGH6 385 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 OR7A10O76100 309 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 BCL10O95999 233 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 THRBP10828 461 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 FUT1P19526 365 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 IFNA8P32881 189 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINF1P36955 418 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 NUDT2P50583 147 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SELENOWP63302 87 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 PPP2R2BQ00005 443 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 PIGFQ07326 219 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 GSG1Q2KHT4 349 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 TREML1Q86YW5 311 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM54Q969K7 222 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 GLTPQ9NZD2 209 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 MED31Q9Y3C7 131 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PRG6 482 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 CXCR6O00574 342 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF682O95780 498 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 OR4A8P0C604 315 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-208ENST00000555806 EFNA4P52798 201 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms