RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	RDH5	Q92781	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	LRR1	Q96L50	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	TG	P01266	2768 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	CLIC1	O00299	241 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	RP2	O75695	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	TF	P02787	698 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	BGLAP	P02818	100 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	PATE4	P0C8F1	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	GAA	P10253	952 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	LMO4	P61968	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB1A	P62820	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	FADD	Q13158	208 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB39A	Q14964	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXB1	Q99853	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-231	ENST00000551931	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TPST2	O60704	377 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINI2	O75830	405 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB36	O95755	333 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	AVP	P01185	164 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ARAF	P10398	606 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ETS2	P15036	469 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEB1	P43366	347 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ACTG1	P63261	375 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GALK2	Q01415	458 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PUDP	Q08623	228 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0B4J2E0	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GX12	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PPW3	197 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PLPP3	O14495	311 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	UBD	O15205	165 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	UBL3	O95164	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	EGR1	P18146	543 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM33	P57088	247 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MIER2	Q8N344	545 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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