RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1W2PPW3 197 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 B4DSR2 109 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 C11orf98E9PRG8 122 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SERPINB7O75635 380 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ARAFP10398 606 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 BMP2P12643 396 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PCMT1P22061 227 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC6A2P23975 617 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 LSP1P33241 339 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SEC24CP53992 1094 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PUDPQ08623 228 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SCARB2Q14108 478 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 C10orf111Q8N326 155 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SCAIQ8N9R8 606 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 LRR1Q96L50 414 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF607Q96SK3 696 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXB1Q99853 325 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0B4J2E0 115 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1B0GX12 115 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 EVPLLA8MZ36 301 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 UBL3O95164 117 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 HPXP02790 462 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 BGLAPP02818 100 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PATE4P0C8F1 98 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ADORA3P0DMS8 318 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 NAT2P11245 290 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF35P13682 527 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIBP23284 216 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 COL8A2P25067 703 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 GLRXP35754 106 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 CSNK1A1P48729 337 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 EVX1P49640 407 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 CDH12P55289 794 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 BIDP55957 195 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB39AQ14964 217 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MSMPQ1L6U9 139 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ELFN2Q5R3F8 820 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 EPGNQ6UW88 154 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 LRP11Q86VZ4 500 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SMYD1Q8NB12 490 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RDH5Q92781 318 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SPDL1Q96EA4 605 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 VAPAQ9P0L0 249 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB21Q9UL25 225 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PLPP3O14495 311 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 FZD7O75084 574 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM157BP0CG42 384 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 ACHEP22303 614 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC18A1P54219 525 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 REP15Q6BDI9 236 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 PXKQ7Z7A4 578 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 CARM1Q86X55 608 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 OR5J2Q8NH18 312 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 OR6S1Q8NH40 331 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 WFDC6Q9BQY6 131 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 OR51B6Q9H340 312 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 TREM2Q9NZC2 230 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-205ENST00000549039 CORO2BQ9UQ03 480 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms