RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ESR2	Q92731	530 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	VGLL1	Q99990	258 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP58	Q9BVL2	599 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CLUH	O75153	1309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	COL1A2	P08123	1366 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		E9PQ18	207 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB5	O15062	677 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL13	O43927	109 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GPX5	O75715	221 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT2B17	O75795	530 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5L	O75964	103 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KBTBD11	O94819	623 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LYPD3	O95274	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN9	O95484	217 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	AP2A1	O95782	977 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GNA11	P29992	359 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LEP	P41159	167 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ELK3	P41970	407 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IST1	P53990	364 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK16	Q00536	496 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PAX2	Q02962	417 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PLD1	Q13393	1074 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RCN1	Q15293	331 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NAXD	Q8IW45	347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2E3	Q969T4	207 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MCHR1	Q99705	422 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB20	Q9NX57	234 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GINS2	Q9Y248	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	F5	P12259	2224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KNTC1	P50748	2209 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GWB2	263 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPV9	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ERICH2	A1L162	156 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HEATR9	A2RTY3	570 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2AG2	A6NM03	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A8MX80	341 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRDC	B7Z8K6	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SULT2B1	O00204	365 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCD4	O14678	606 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG3	O60359	315 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10H3	O60404	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PFKFB2	O60825	505 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GNA14	O95837	355 aa		3.14	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms