RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HERC2O95714 4834 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLSCR5A0PG75 271 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERTM1A2A2V5 107 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM9SF1O15321 606 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFLARO15519 480 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF205O95201 554 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf47O95873 294 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINA5P05154 406 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTA2P09210 222 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MATN1P21941 496 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTG1P62324 171 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ10P78508 379 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK5R2Q13319 367 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0040Q15053 153 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOGQ16653 247 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM209AQ5JX71 171 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF130Q86XS8 419 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDIASQ8IXT1 998 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIER2Q8N344 545 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2M2Q96R28 347 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMC6Q9BV81 110 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP28Q9H239 520 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.5□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYSTQ99698 3801 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX19O60806 448 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBL3O95164 117 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNMTP11086 282 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMP1P11279 417 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEA4P43358 317 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IER3P46695 156 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKNOX1P55347 436 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCP2P55851 309 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALCOCO2Q13137 446 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAB1Q13506 487 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASC10Q5T4H9 136 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATG16L1Q676U5 607 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CADM2Q8N3J6 435 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R3HDM4Q96D70 268 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC126Q96EE4 140 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B9D2Q9BPU9 175 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.49□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF121Q9H920 327 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM165Q9HC07 324 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSL2Q9HCI7 577 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR45Q9Y484 360 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U3KQK5 164 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.49□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0U1RQK1 487 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN9O75954 239 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-13P01766 116 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTA1P08263 222 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT2P09544 360 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAC1P20366 129 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMPDH1P20839 514 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNOP22674 350 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRA5P31644 462 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPV17P39210 176 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP15P51511 669 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMS2P3Q13401 168 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL22Q53GT1 634 aa8.48□□□□□ -1.05
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