RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	BID	P55957	195 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FXN	Q16595	210 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588		Q5PR19	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	OVOL3	O00110	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	HSD17B1	P14061	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	AQP2	P41181	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MELK	Q14680	651 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TMCC2	O75069	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	F13B	P05160	661 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MAK	P20794	623 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CSNK1A1	P48729	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	RUNX1T1	Q06455	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A087WUU8	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM107A	O95990	144 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	BCL10	O95999	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	CELA3B	P08861	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	IFI30	P13284	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	IFNA8	P32881	189 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	FHL1	Q13642	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAM2	Q15035	370 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERF1B-208	ENST00000515588	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CECR9	P0C854	216 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CBR1	P16152	277 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TTK	P33981	857 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CDKN1A	P38936	164 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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