RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF525Q8N782 197 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MRAPQ8TCY5 172 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC45Q96CN5 670 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OMDQ99983 421 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CENPHQ9H3R5 247 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 POMKQ9H5K3 350 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FANCFQ9NPI8 374 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NYAP2Q9P242 653 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MGAQ8IWI9 3026 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DNHD1Q96M86 4753 aa3.21□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ABCB11O95342 1321 aa3.21□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.21□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 FAM168BA1KXE4 195 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 F5H6K3 240 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 F8VZ95 297 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 G3V4G9 280 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OR7A17O14581 309 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TNFSF11O14788 317 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 MSH4O15457 936 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 DEXIO95424 95 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 CCNB1P14635 433 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TPSB2P20231 275 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 HNF1AP20823 631 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 CCNE1P24864 410 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP5-9P26371 169 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OTX2P32243 289 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KLK7P49862 253 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 MEOX2P50222 304 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KCNJ2P63252 427 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KLRC3Q07444 240 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RAB40BQ12829 278 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R7Q15435 360 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TPSAB1Q15661 275 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 CFAP221Q4G0U5 840 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TTC23Q5W5X9 447 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PMF1Q6P1K2 205 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 Q6ZR54 194 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RGS9BPQ6ZS82 235 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TPRA1Q86W33 373 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF677Q86XU0 584 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SYT14Q8NB59 555 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OR2T3Q8NH03 318 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RLN3Q8WXF3 142 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KIR2DL4Q99706 377 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PAXXQ9BUH6 204 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RMND1Q9NWS8 449 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF221Q9UK13 617 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.21□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 B4DXG7 233 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SULT2B1O00204 365 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 WWP2O00308 870 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 TBL1XO60907 577 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 UGT2B17O75795 530 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms