RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802		H0Y8G0	127 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL21	O00585	134 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PEX7	O00628	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ERLIN2	O94905	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CSF3	P09919	207 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CASP14	P31944	242 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	RORA	P35398	523 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CRYBB2	P43320	205 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SULT1E1	P49888	294 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	UCN	P55089	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXW4	P57775	412 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PLP1	P60201	277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SGCA	Q16586	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802		Q8N9L7	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	STMN2	Q93045	179 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	LAD1	O00515	517 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	GOSR2	O14653	212 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A27	O95847	323 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	MCF2	P10911	925 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	NMU	P48645	174 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CCR6	P51684	374 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CRISP3	P54108	245 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNJ2	P63252	427 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SSX2	Q16385	188 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PIGG	Q5H8A4	983 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802		Q6P435	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	MED8	Q96G25	268 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	MSH6	P52701	1360 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802		H3BNH8	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SOX15	O60248	233 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SUPT3H	O75486	399 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SNX4	O95219	450 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFB10	O96000	172 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CT62	P0C5K7	136 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	ADRB3	P13945	408 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CNR1	P21554	472 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	IFNA8	P32881	189 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SMARCB1	Q12824	385 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	ZBED5	Q49AG3	693 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SGK3	Q96BR1	496 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC58	Q96CX6	371 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	TPD52L3	Q96J77	140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	RARRES2	Q99969	163 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PKIB	Q9C010	78 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SKAP2-208	ENST00000495802	PISD	Q9UG56	409 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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