RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, human

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM17B-208	ENST00000495490	RAB39A	Q14964	217 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ITM2A	O43736	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SPAG7	O75391	227 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	UBL3	O95164	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RAB36	O95755	333 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SERPINA5	P05154	406 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF250	P15622	560 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	HOXC5	Q00444	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	FOXB1	Q99853	325 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	IL12A	P29459	219 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RAD52	P43351	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CRISP3	P54108	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	UFM1	P61960	85 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	IL13RA1	P78552	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	TEK	Q02763	1124 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	MED29	Q9NX70	200 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	KRT75	O95678	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	BCHE	P06276	602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ETV4	P43268	484 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	USP51	Q70EK9	711 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490		A0A087WUJ7	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ETFA	P13804	333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	LBP	P18428	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CBL	P22681	906 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	LSP1	P33241	339 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	SELENOV	P59797	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	LCN2	P80188	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17B-208	ENST00000495490	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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