RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490667.1

SHC1-211, Transcript of SHC adaptor protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SHC1, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1-211ENST00000490667 IFNA8P32881 189 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 CSNK1A1P48729 337 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 UGT2B15P54855 530 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 GNGT1P63211 74 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 ST3GAL3Q11203 375 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 ZNF544Q6NX49 715 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 MUC15Q8N387 334 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 OR6X1Q8NH79 312 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 PFN4Q8NHR9 129 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 SMR3AQ99954 134 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 MED31Q9Y3C7 131 aa11.47□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 NDUFS7O75251 213 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 SEC14L2O76054 403 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 OR7A10O76100 309 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 BCL10O95999 233 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 CRYAAP02489 173 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 IFNW1P05000 195 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 CAPZA2P47755 286 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 CBLL1Q75N03 491 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 LIPHQ8WWY8 451 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 TMEM54Q969K7 222 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 PRRC1Q96M27 445 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.46□□□□□ -0.57
SHC1-211ENST00000490667 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 SERPINA1P01009 418 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 IGKV3-15P01624 115 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 IGLV1-44P01699 117 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 IGHV4-39P01824 125 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CECR9P0C854 216 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 NCK1P16333 377 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ARR3P36575 388 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 AQP2P41181 271 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 NAAAQ02083 359 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CHRNB3Q05901 458 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 TNK1Q13470 666 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 MELKQ14680 651 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 LAPTM4AQ15012 233 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ETFDHQ16134 617 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 IFI44LQ53G44 452 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ZNF627Q7L945 461 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ZNF566Q969W8 418 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 FAM162AQ96A26 154 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 GLTPQ9NZD2 209 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ADA2Q9NZK5 511 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 RHCGQ9UBD6 479 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 A0A1W2PRG6 482 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 J3KTA2 159 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 FFAR1O14842 300 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 PIP5K1CO60331 668 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 HLA-HP01893 362 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 F13BP05160 661 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CELA3BP08861 270 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 CD79AP11912 226 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 BMP4P12644 408 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 FUT4P22083 530 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 ACVR1BP36896 505 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 PIGFQ07326 219 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 TRAM2Q15035 370 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 RAB35Q15286 201 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 GLYATQ6IB77 296 aa11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SHC1-211ENST00000490667 MDP1Q86V88 176 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms