RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490203.5

ELF3-208, Transcript of E74 like ETS transcription factor 3, human

TSL 5

Gene ELF3, Length 885 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELF3-208	ENST00000490203	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	RASD2	Q96D21	266 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203		Q96M85	177 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MED29	Q9NX70	200 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SLC43A1	O75387	559 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TXNDC12	O95881	172 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	REN	P00797	406 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	IGHG1	P01857	330 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CLRN1	P58418	232 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TLE1	Q04724	770 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	KEAP1	Q14145	624 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	NIPAL3	Q6P499	406 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ADCK1	Q86TW2	530 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OR4K13	Q8NH42	304 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OTULIN	Q96BN8	352 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	PITX2	Q99697	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203		M0R3G1	203 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	KRT33A	O76009	404 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	NR2C1	P13056	603 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ACADS	P16219	412 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TIMP3	P35625	211 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	PCYT1A	P49585	367 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SIRPA	P78324	504 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	IL5RA	Q01344	420 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CD47	Q08722	323 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	IL18R1	Q13478	541 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TMEM45B	Q96B21	275 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ELF3-208	ENST00000490203	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ELF3-208	ENST00000490203	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ELF3-208	ENST00000490203		E9PLN8	166 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ELF3-208	ENST00000490203	SURF4	O15260	269 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ELF3-208	ENST00000490203	MPZL2	O60487	215 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ELF3-208	ENST00000490203	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms