RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	ERICH4	A6NGS2	130 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	FAM25E	A8MYX2	175 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	RAMP3	O60896	148 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJB6	O75190	326 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CDH16	O75309	829 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	KRT14	P02533	472 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	STAG3L3	P0CL85	134 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	RALB	P11234	206 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	GZMA	P12544	262 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ABO	P16442	354 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CHML	P26374	656 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	MAGEA1	P43355	309 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	GYG1	P46976	350 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TPMT	P51580	245 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	SFT2D3	Q587I9	215 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	COX15	Q7KZN9	410 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	MDS2	Q8NDY4	140 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ACER1	Q8TDN7	264 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PEX13	Q92968	403 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	C10orf35	Q96D05	121 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ITCH	Q96J02	903 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	OXGR1	Q96P68	337 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	SIAE	Q9HAT2	523 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0G2JN53	185 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334		C9JVG2	144 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	NBR2	O15453	112 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PRKAB2	O43741	272 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	DFNA5	O60443	496 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	IGKV3-11	P04433	115 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CRISP2	P16562	243 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ATP1B3	P54709	279 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC63	Q05C16	580 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	GPNMB	Q14956	572 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PSG5	Q15238	335 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM107	Q6UX40	140 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF786	Q8N393	782 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TRPV1	Q8NER1	839 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	AZI2	Q9H6S1	392 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	FANCE	Q9HB96	536 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	BFAR	Q9NZS9	450 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	DEC1	Q9P2X7	70 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TMCO1	Q9UM00	188 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC182	A6NF36	153 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	HAS3	O00219	553 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	HSD17B6	O14756	317 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CLDN9	O95484	217 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A27	O95847	323 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF24	P17028	368 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	CD1C	P29017	333 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PPOX	P50336	477 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	ENPEP	Q07075	957 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	MERTK	Q12866	999 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	OR5I1	Q13606	314 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	XKR7	Q5GH72	579 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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