RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFS8O00217 210 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MGRN1O60291 552 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ENTPD5O75356 428 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 KRT34O76011 436 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LYPD3O95274 346 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CH25HO95992 272 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IGF2P01344 180 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OPN1SWP03999 348 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 THY1P04216 161 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OR4A8P0C604 315 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CALCRP30988 508 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PDLIM4P50479 330 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TUBA1BP68363 451 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TUBA4AP68366 448 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HGFACQ04756 655 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CAMK2DQ13557 499 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 EFNB3Q15768 340 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ADIPOQQ15848 244 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF74Q16587 644 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CARD17Q5XLA6 110 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TUBA1AQ71U36 451 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MDP1Q86V88 176 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 C10orf82Q8WW14 230 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TAMM41Q96BW9 452 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF583Q96ND8 569 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 DOK1Q99704 481 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PLK3Q9H4B4 646 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SAR1AQ9NR31 198 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MED29Q9NX70 200 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GLTPQ9NZD2 209 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FKBP7Q9Y680 259 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 A0A096LNT2 108 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM129A0AVI4 362 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf98E9PRG8 122 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MRASO14807 208 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A2O15244 555 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RNF13O43567 381 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GPRIN2O60269 458 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OR5F1O95221 314 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 BCL10O95999 233 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MT-ND1P03886 318 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 THRBP10828 461 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CD79AP11912 226 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IFNGR1P15260 489 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FUT1P19526 365 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NPR2P20594 1047 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NR4A1P22736 598 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 KDELR2P33947 212 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 THBS4P35443 961 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CAPZA2P47755 286 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CSNK1A1P48729 337 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 EVX1P49640 407 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PPOXP50336 477 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CRYBA2P53672 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 BIDP55957 195 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RAB1AP62820 205 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 VLDLRP98155 873 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 DAG1Q14118 895 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GSG1Q2KHT4 349 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RABL3Q5HYI8 236 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 VHLLQ6RSH7 139 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CARM1Q86X55 608 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF525Q8N782 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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