RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DACH2Q96NX9 599 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PRR14Q9BWN1 585 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SCN2AQ99250 2005 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 NINQ8N4C6 2090 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 AQP7O14520 342 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN14O95500 239 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ECH1Q13011 328 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GINS1Q14691 196 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF141Q15928 474 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZBED5Q49AG3 693 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 USP22Q9UPT9 525 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TSPAN2O60636 221 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DKK1O94907 266 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 AKR1D1P51857 326 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CAPZA1P52907 286 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SELPLGQ14242 412 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 LAPTM4AQ15012 233 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DESI1Q6ICB0 168 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC103Q8IW40 242 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GPR119Q8TDV5 335 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RAB26Q9ULW5 256 aa8.35□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 A0A096LPE4 126 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PPZ6 126 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IRGMA1A4Y4 181 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 H3BNX3 289 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SURF4O15260 269 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 LYZL6O75951 148 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 NEURL1O76050 574 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ABHD16AO95870 558 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 LGI1O95970 557 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 THRBP10828 461 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IFNGR1P15260 489 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF83P51522 516 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OXA1LQ15070 435 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CD226Q15762 336 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF786Q8N393 782 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC18Q8N456 261 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 FBXO17Q96EF6 278 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PGAM5Q96HS1 289 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TIMP4Q99727 224 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RASSF1Q9NS23 344 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 F5H5K5 113 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PPP1R3DO95685 299 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CD2P06729 351 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF17P17021 662 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CTRB1P17538 263 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PTPN6P29350 595 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PHC1P78364 1004 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CBLL1Q75N03 491 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SAMD8Q96LT4 415 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PIGMQ9H3S5 423 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ONECUT2O95948 504 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 STSP08842 583 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TACSTD2P09758 323 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 G0S2P27469 103 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 HTR5AP47898 357 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DUSP7Q16829 419 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SLC51BQ86UW2 128 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OR8S1Q8NH09 359 aa8.34□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms