RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMG1P04279 462 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 F13BP05160 661 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CD3EP07766 207 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PATE4P0C8F1 98 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNGR1P15260 489 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 AHCYP23526 432 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CD40P25942 277 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM162AQ96A26 154 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 V9GYQ6 96 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZANQ9Y493 2812 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 B2RBV5 119 aa6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 LIPHQ8WWY8 451 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB10Q8WXI3 467 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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