RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449023.1

SRGAP3-AS4-201, SRGAP3 antisense RNA 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRGAP3-AS4, Length 377 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 NEURL3Q96EH8 262 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RADILQ96JH8 1075 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ZIM3Q96PE6 472 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SORT1Q99523 831 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 POLE3Q9NRF9 147 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 EXD2Q9NVH0 621 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ASB6Q9NWX5 421 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 EMC3Q9P0I2 261 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 MALT1Q9UDY8 824 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 OSGIN1Q9UJX0 560 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 WDR45Q9Y484 360 aa4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 A0A1W2PPL8 197 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CIB4A0PJX0 185 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 AGAP5A6NIR3 686 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RNF212BA8MTL3 300 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 H3BUI4 141 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 H7C417 338 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 M0R1B8 84 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 BIRC5O15392 142 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ZNF208O43345 1280 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 DNPH1O43598 174 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 PIP5K1CO60331 668 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 LY6HO94772 140 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 AGR2O95994 175 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SERPINE1P05121 402 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CHRM4P08173 479 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 MYZAPP0CAP1 466 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TNFSF4P23510 183 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TACR3P29371 465 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 IL12AP29459 219 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CDKN2CP42773 168 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC1A3P43003 542 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 FABP6P51161 128 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 NME5P56597 212 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 UFM1P61960 85 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC17A1Q14916 467 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RAB39AQ14964 217 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RAB35Q15286 201 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CHI3L2Q15782 390 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 NRF1Q16656 503 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 GPAT3Q53EU6 434 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 C6orf52Q5T4I8 152 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 RNF130Q86XS8 419 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 MUC15Q8N387 334 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ZNF525Q8N782 197 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ZNF563Q8TA94 476 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 PIGXQ8TBF5 258 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 CCDC115Q96NT0 180 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 INPP5KQ9BT40 448 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 NUF2Q9BZD4 464 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 DPY30Q9C005 99 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC38A1Q9H2H9 487 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC17A5Q9NRA2 495 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.95□□□□□ -1.62
SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 PNPOQ9NVS9 261 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms