RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 OR2L13Q8N349 312 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NOX4Q9NPH5 578 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RCE1Q9Y256 329 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 JTBO76095 146 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SPP1P10451 314 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 AOAHP28039 575 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CARD18P57730 90 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OPCMLQ14982 345 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RTL8BQ17RB0 113 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SYT13Q7L8C5 426 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LMO3Q8TAP4 145 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 C5AR2Q9P296 337 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SNED1Q8TER0 1413 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SMLR1H3BR10 107 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CHEK1O14757 476 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SCG5P05408 212 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CTRB1P17538 263 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DUSP1P28562 367 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 S100A11P31949 105 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ILKQ13418 452 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF583Q96ND8 569 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 BOCQ9BWV1 1114 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 JAM3Q9BX67 310 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HTR1FP30939 366 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SSTR4P31391 388 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NDUFA6P56556 154 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 UBE2G1P62253 170 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TAZQ16635 292 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TIGITQ495A1 244 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 IER5LQ5T953 404 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF626Q68DY1 528 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 FAM122BQ7Z309 247 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NXPE3Q969Y0 559 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SYT5O00445 386 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TGM4P49221 684 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ASB11Q8WXH4 323 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SEH1LQ96EE3 360 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 H0YIV9 168 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RAD1O60671 282 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HBA1P69905 142 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF91Q05481 1191 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SQSTM1Q13501 440 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 Q499Y3 187 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NPWQ8N729 165 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ASB13Q8WXK3 278 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MARC2Q969Z3 335 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DEGS1O15121 323 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 S100A8P05109 93 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OMGP23515 440 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ACKR3P25106 362 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GJA5P36382 358 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ETV1P50549 477 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 BTN1A1Q13410 526 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GAB1Q13480 694 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HES1Q14469 280 aa6.19□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms