RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 SMR3AQ99954 134 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 EMC6Q9BV81 110 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-216ENST00000428482 A0A096LPE4 126 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PPZ6 126 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM64BA6NI03 449 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 OR5H1A6NKK0 313 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 C11orf98E9PRG8 122 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 M0R1B8 84 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ABCD4O14678 606 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 HS3ST1O14792 307 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CHP2O43745 196 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 GOSR1O95249 250 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 THRBP10828 461 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CDKN1AP38936 164 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 LIMS1P48059 325 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 NR1H2P55055 460 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ADAM8P78325 824 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ACKR1Q16570 336 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM123Q8N131 208 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00471Q8N535 108 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MBD6Q96DN6 1003 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TPD52L3Q96J77 140 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 EPYCQ99645 322 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM2Q9C040 744 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 OR10A4Q9H209 315 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 C12orf10Q9HB07 376 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 DLL4Q9NR61 685 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ASB6Q9NWX5 421 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 V9GYQ6 96 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CIB4A0PJX0 185 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFS7O75251 213 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF432O94892 652 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 IFNW1P05000 195 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 PPP3CBP16298 524 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ERFP50548 548 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ARHGDIAP52565 204 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF74Q16587 644 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 PGGHGQ32M88 737 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ULK3Q6PHR2 472 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 TXNDC15Q96J42 360 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 RDH12Q96NR8 316 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 OR2M2Q96R28 347 aa8.95□□□□□ -0.98
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HDLBP-216ENST00000428482 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.95□□□□□ -0.98
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HDLBP-216ENST00000428482 RHCGQ9UBD6 479 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 UPB1Q9UBR1 384 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PRQ8 180 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 G3V2T6 193 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MS4A18H0YCH9 400 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 GPR171O14626 319 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CH25HO95992 272 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 CD3EP07766 207 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 MPGP29372 298 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-216ENST00000428482 PTH2RP49190 550 aa8.94□□□□□ -0.98
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