RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPNQ5VXI9 398 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUBPLQ8TB37 319 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM63Q969Q1 353 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR76Q9H967 626 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0B4J203 849 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOD1A6NK06 481 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TFPIP10646 304 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRMP19623 302 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHCYP23526 432 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP6Q96JE9 813 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL15Q96M94 604 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MNTQ99583 582 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.91■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WV48 116 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LANCL1O43813 399 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACKR1Q16570 336 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF519Q8TB69 540 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK35Q8TDR2 534 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFT1Q96AA3 541 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ORAI1Q96D31 301 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCD1Q96NT3 240 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD1Q96SE0 405 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS14Q96SY0 518 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD7Q9NPI1 651 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHSA1O95433 338 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPANK1O95872 356 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALOX5APP20292 161 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMP2P54851 167 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM234Q8WY98 164 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGKQ92643 395 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DERL3Q96Q80 235 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM165Q9HC07 324 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLKQ9UBE8 527 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.9■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS37A4D1T9 235 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf72A6NCS6 295 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB1P43366 347 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EID2Q8N6I1 236 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAT6Q93015 286 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HGDQ93099 445 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RELTQ969Z4 430 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP7Q9Y680 259 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD61A6NGH8 418 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLPP3O14495 311 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ONECUT2O95948 504 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDGF1P13385 188 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGR3Q06889 387 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF417Q8TAU3 575 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX18Q96RF0 628 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPSB2Q99619 263 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFI1Q99684 422 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms