RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424993.1

SNX18P3-201, Transcript of sorting nexin 18 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SNX18P3, Length 835 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18P3-201ENST00000424993 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PRSS50Q9UI38 385 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CENPBD1B2RD01 187 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 G3V2T6 193 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 DVL2O14641 736 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 RNF13O43567 381 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 MGRN1O60291 552 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OR10H3O60404 316 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CCNB2O95067 398 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ADAP00813 363 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 GASTP01350 101 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF43P17038 809 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 GSTM3P21266 225 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OPRM1P35372 400 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SELENOPP49908 381 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CLDN17P56750 224 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PUDPQ08623 228 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FAM27E3Q08E93 113 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FHL1Q13642 323 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 MELKQ14680 651 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZBED5Q49AG3 693 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 NIPAL3Q6P499 406 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FAHD1Q6P587 224 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 AAED1Q7RTV5 226 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM45BQ96B21 275 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 LRR1Q96L50 414 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 FEVQ99581 238 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 C8orf4Q9NR00 106 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PROCRQ9UNN8 238 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 JMJD1CQ15652 2540 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC35F4A4IF30 521 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 UNC119BA6NIH7 251 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 A8MXE2 369 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IMPA2O14732 288 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 ARPC3O15145 178 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IDH3BO43837 385 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 AHCYL1O43865 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OR6A2O95222 327 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IGHMP01871 453 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CD8BP10966 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 IFNGR1P15260 489 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 BIDP55957 195 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 TFF3Q07654 80 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CAMK2DQ13557 499 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 STK11Q15831 433 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 CASP12Q6UXS9 341 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OAFQ86UD1 273 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 UEVLDQ8IX04 471 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 PARP8Q8N3A8 854 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX18P3-201ENST00000424993 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms