RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51F2Q8NH61 342 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAL2Q969L2 176 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIPF5Q969M3 257 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRR1Q96L50 414 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMC6Q9BV81 110 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED29Q9NX70 200 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WUJ7 227 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A18H0YCH9 400 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT9BO14905 357 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCR1O76036 304 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KITP10721 976 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP2P12643 396 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIPRP48546 466 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FADDQ13158 208 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGNQ15493 299 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MREGQ8N565 214 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAIQ8N9R8 606 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGARPQ8TDB4 240 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXB1Q99853 325 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED4Q9NPJ6 270 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TREM2Q9NZC2 230 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZR1Q9UM11 496 aa11.3□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPW3 197 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf58C9J3I9 102 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RP2O75695 350 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBL3O95164 117 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPP00491 289 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETS2P15036 469 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP5P55064 265 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM33P57088 247 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB1AP62820 205 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK2DQ13557 499 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMTD1Q86VU5 262 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX32Q86XE0 403 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDFY1Q8IWB7 410 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6S1Q8NH40 331 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC15Q96J42 360 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPYCQ99645 322 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPNQ9BXN1 380 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP1Q9NVV9 213 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV20A0A0B4J274 112 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLIC1O00299 241 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BGLAPP02818 100 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT2P11245 290 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSP1P33241 339 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HILS1P60008 231 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCALDP61601 193 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMO4P61968 165 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUDPQ08623 228 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HHATQ5VTY9 493 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULK3Q6PHR2 472 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP43Q70EL4 1123 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2H4Q92759 462 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPHQ9H3R5 247 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENONQ9NZV5 590 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP13Q9UII6 198 aa11.28□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 344.9 ms