RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.45□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51A7Q8NH64 312 aa13.45□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNDC8Q8TC99 324 aa13.45□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMC6Q9BV81 110 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNIPQ9H3M7 391 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NIZ1 184 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTP4A3O75365 173 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAD51DO75771 328 aa13.44□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf94Q6P1W5 598 aa13.44□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM54Q969K7 222 aa13.44□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.44□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIGLEC7Q9Y286 467 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARRDC5A6NEK1 342 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC119BA6NIH7 251 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R3G1 203 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNB2O95067 398 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF627Q7L945 461 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1K1Q8NGR3 316 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FREM3P0C091 2139 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.42□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNGT2O14610 69 aa13.42□□□□□ -0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHCYL1O43865 530 aa13.42□□□□□ -0.26
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