RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368243.5

C1orf61-204, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf61, Length 879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-204ENST00000368243 DUSP13Q9UII6 198 aa9.06□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.06□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 OR2T1O43869 369 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CDC14BO60729 498 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CLPTM1O96005 669 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 FAM157BP0CG42 384 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 BMP2P12643 396 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 PRKAR1BP31321 381 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CDH12P55289 794 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 BIDP55957 195 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 STX1BP61266 288 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ERVS71-1P61550 626 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RAB1AP62820 205 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 GLO1Q04760 184 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SCARB2Q14108 478 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 AVPI1Q5T686 147 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 REEP3Q6NUK4 255 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 EPGNQ6UW88 154 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF75AQ96N20 296 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SH3GL3Q99963 347 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SELENONQ9NZV5 590 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.05□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 A0A0B4J2E0 115 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 A0A1B0GX12 115 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 A0A1W2PPW3 197 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF726A6NNF4 738 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 VSTM5A8MXK1 200 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 M0R233 179 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 PLPP3O14495 311 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SYNGR3O43761 229 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 FZD7O75084 574 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RAB36O95755 333 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ADORA3P0DMS8 318 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF35P13682 527 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ETS2P15036 469 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 THBS2P35442 1172 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 MAGEB1P43366 347 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CSNK1A1P48729 337 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 IDH3AP50213 366 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 MYBPC1Q00872 1141 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 PUDPQ08623 228 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 FADDQ13158 208 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SELPLGQ14242 412 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 NPTX1Q15818 432 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 AGKQ53H12 422 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 LIPNQ5VXI9 398 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ULK3Q6PHR2 472 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 DEF8Q6ZN54 512 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SKA3Q8IX90 412 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SPDL1Q96EA4 605 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 FOXB1Q99853 325 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 C12orf10Q9HB07 376 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 RAB21Q9UL25 225 aa9.04□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 CH25HO95992 272 aa9.03□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 THY1P04216 161 aa9.03□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 MTPNP58546 118 aa9.03□□□□□ -0.96
C1orf61-204ENST00000368243 GALK2Q01415 458 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms