RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CARM1Q86X55 608 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UEVLDQ8IX04 471 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SCAIQ8N9R8 606 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BOD1Q96IK1 185 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TPD52L3Q96J77 140 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR2M2Q96R28 347 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ASPNQ9BXN1 380 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FKRPQ9H9S5 495 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 JMJD1CQ15652 2540 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HIVEP2P31629 2446 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LPE4 126 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPZ6 126 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 E7EQL1 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LRRN3E7EW58 273 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ATP6P00846 226 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA1P01009 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGF2P01344 180 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CD8AP01732 235 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-39P01824 125 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HEXAP06865 529 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FABP6P51161 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBA2P53672 197 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM11AP58511 58 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CBX1P83916 185 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LTBQ06643 244 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PUDPQ08623 228 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ST3GAL3Q11203 375 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PMS2P3Q13401 168 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TAF11Q15544 211 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP6Q5VW22 663 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GLYATQ6IB77 296 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM123Q8N131 208 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MUC15Q8N387 334 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PRRC1Q96M27 445 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LRGUKQ96M69 825 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NELFAQ9H3P2 528 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GPR35Q9HC97 309 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CD300AQ9UGN4 299 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A18H0YCH9 400 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 M0R3G1 203 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 EBAG9O00559 213 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP3O14495 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC2O15144 300 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS7O75251 213 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINI2O75830 405 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms