RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A13Q8TCU3 470 aa23.59■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 FOXC2Q99958 501 aa23.59■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 UBOX5O94941 541 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 CD40P25942 277 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 PRPS1P60891 318 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCDQ05655 676 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 FHL1Q13642 323 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD16Q6P6B7 361 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 PODNL1Q6PEZ8 512 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF730Q6ZMV8 503 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 CYP4Z1Q86W10 505 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 OR13C2Q8NGS9 318 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 OR6X1Q8NH79 312 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM54Q969K7 222 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 LRR1Q96L50 414 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 ULBP2Q9BZM5 246 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.58■■□□□ 1.37
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MYO9AB2RTY4 2548 aa23.58■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV27A0A087WT01 109 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 H1F0P07305 194 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 RHCEP18577 417 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 GPR4P46093 362 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CSNK1A1P48729 337 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SPATS1Q496A3 300 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL24Q6TFL4 600 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SSX8Q7RTT4 187 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 IGFBPL1Q8WX77 278 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CCL19Q99731 98 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 INIPQ9NRY2 104 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 EDARQ9UNE0 448 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CDC42EP2O14613 210 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MS4A2Q01362 244 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SEC23BQ15437 767 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FGD3Q5JSP0 725 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 B3GLCTQ6Y288 498 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 C20orf204Q6ZNR8 217 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 IGFN1Q86VF2 1251 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF611Q8N823 705 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 OR51A7Q8NH64 312 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ASB10Q8WXI3 467 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 DHRS1Q96LJ7 313 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PIP5K1AQ99755 562 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD19PQ9H560 264 aa23.56■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PRQ8 180 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB9A8MZ26 197 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 BCL10O95999 233 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PGA4P0DJD7 388 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PGA3P0DJD8 388 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PTAFRP25105 342 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 DGCR6Q14129 220 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL17Q6TDP4 642 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC75AQ8NAA5 344 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 OR52J3Q8NH60 311 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ALPK1Q96QP1 1244 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FUZQ9BT04 418 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SEC61A2Q9H9S3 476 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 GLTPQ9NZD2 209 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.55■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ALG10Q5BKT4 473 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 HTRA1Q92743 480 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF566Q969W8 418 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 NOX3Q9HBY0 568 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 OBP2BQ9NPH6 170 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.54■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PRG6 482 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 WNT11O96014 354 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SOD3P08294 240 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 B4GALT1P15291 398 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CDH11P55287 796 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MYBPC1Q00872 1141 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms