RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CORO6Q6QEF8 472 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NETO2Q8NC67 525 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR51G2Q8NGK0 314 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR10K1Q8NGX5 313 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 GPR171O14626 319 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 METTL9Q9H1A3 318 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0B4J2A0 478 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CES4AQ5XG92 561 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPV4 95 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 GLCEO94923 617 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM131Q92545 1883 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TARM1B6A8C7 271 aa4.55□□□□□ -1.68
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