RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 THRSPQ92748 146 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 POFUT1Q9H488 388 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 IL21RQ9HBE5 538 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 FANCFQ9NPI8 374 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 TMEM100Q9NV29 134 aa10.27□□□□□ -0.76
GINS3-202ENST00000328514 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.27□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 OR6C68A6NDL8 312 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 IDSB3KWA1 339 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MCIDASD6RGH6 385 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 WNT11O96014 354 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CPMP14384 443 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 AK4P27144 223 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 BDKRB2P30411 391 aa10.27□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 GPR143P51810 404 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ARHGDIBP52566 201 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A1P53007 311 aa10.27□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 TAS2R19P59542 299 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 BTN3A2P78410 334 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LIPNQ5VXI9 398 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 Q7L0L9 218 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DEFB123Q8N688 67 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COX18Q8N8Q8 333 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NT5CQ8TCD5 201 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR8D1Q8WZ84 308 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 FAM122AQ96E09 287 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PRO3102Q9H379 93 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 XKR8Q9H6D3 395 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FBXO34Q9NWN3 711 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LAMA3Q16787 3333 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PRR19A6NJB7 356 aa10.26□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 SLC25A12O75746 678 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SNAPINO95295 136 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FGF19O95750 216 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CD3DP04234 171 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 C8AP07357 584 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NAT2P11245 290 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CD79AP11912 226 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PAX6P26367 422 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G7Q13093 441 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SERTAD2Q14140 314 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HSPB2Q16082 182 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GUCA2BQ16661 112 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ALG11Q2TAA5 492 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NDUFAF7Q7L592 441 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.26□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.26□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 GRHL3Q8TE85 626 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RSPRY1Q96DX4 576 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF75AQ96N20 296 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SEMA6CQ9H3T2 930 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FKRPQ9H9S5 495 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RXFP3Q9NSD7 469 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR4C45A6NMZ5 311 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 F8VVB4 439 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 F8VWA3 439 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MOSPD3O75425 235 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SMIM10L1P0DMW3 83 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FOLR2P14207 255 aa10.25□□□□□ -0.77
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