RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 SLC43A1O75387 559 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LYZL6O75951 148 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 KRT33AO76009 404 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF432O94892 652 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RAP2AP10114 183 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 GPR4P46093 362 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TSC22D1Q15714 1073 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PHC2Q8IXK0 858 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FUZQ9BT04 418 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 DHRS12A0PJE2 317 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF726A6NNF4 738 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RNF212BA8MTL3 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 INAFM1C9JVW0 142 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CASKO14936 926 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 KRT36O76013 467 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TSPAN19P0C672 248 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 IFNGR1P15260 489 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 AQP2P41181 271 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLC9A3P48764 834 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SEC23BQ15437 767 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TXNDC15Q96J42 360 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 OR2M2Q96R28 347 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 EMC6Q9BV81 110 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 INIPQ9NRY2 104 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RASSF1Q9NS23 344 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MED29Q9NX70 200 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 EDARQ9UNE0 448 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 AURKCQ9UQB9 309 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.9□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 A0A1W2PRG6 482 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CIB4A0PJX0 185 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 SLC35F4A4IF30 521 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 PDLIM1O00151 329 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ITGA5P08648 1049 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 MPGP29372 298 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 BIDP55957 195 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 LGALS3BPQ08380 585 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ASRGL1Q7L266 308 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OAFQ86UD1 273 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CDC20BQ86Y33 519 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM123Q8N131 208 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 S100PBPQ96BU1 408 aa14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CADP27708 2225 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 TNFRSF11BO00300 401 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CLOCKO15516 846 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 UPK3AO75631 287 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 RAD51DO75771 328 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 BCL10O95999 233 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 F13BP05160 661 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OMPP47874 163 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 TGFBR3Q03167 851 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CAMK2DQ13557 499 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 LAPTM4AQ15012 233 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 ALG10Q5BKT4 473 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 CARD17Q5XLA6 110 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OR2T29Q8NH02 315 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OR51A7Q8NH64 312 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 OR6X1Q8NH79 312 aa14.88□□□□□ -0.03
SFTPC-201ENST00000318561 LRR1Q96L50 414 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms