RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 LAP3P28838 519 aa8.66□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 TATDN3Q17R31 274 aa8.66□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 NLRP8Q86W28 1048 aa8.66□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 OR2L13Q8N349 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.65□□□□□ -1.02
CUX1-201ENST00000292535 AIFM1O95831 613 aa8.65□□□□□ -1.02
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CUX1-201ENST00000292535 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.65□□□□□ -1.02
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CUX1-201ENST00000292535 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.65□□□□□ -1.02
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CUX1-201ENST00000292535 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 ZNF91Q05481 1191 aa8.64□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 GPLD1P80108 840 aa8.64□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RICTORQ6R327 1708 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 BPIFB3P59826 476 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LTC4SQ16873 150 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CDC20BQ86Y33 519 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ASB11Q8WXH4 323 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 WDR76Q9H967 626 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 IL37Q9NZH6 218 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 H3BMQ9 156 aa8.64□□□□□ -1.03
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