RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MYOTQ9UBF9 498 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SDK1Q7Z5N4 2213 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TLCD2A6NGC4 264 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HSBP1L1C9JCN9 74 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 I6L893 689 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 S100A11P31949 105 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DCDP81605 110 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0B4J2A0 478 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ARGFXA6NJG6 315 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF12O43508 249 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CBX7O95931 251 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HBE1P02100 147 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 FUCA1P04066 466 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A12P48065 614 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R2Q8NFZ6 395 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RNF141Q8WVD5 230 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA4Q9BXL8 241 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SHPKQ9UHJ6 478 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OCSTAMPQ9BR26 566 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf85Q9H1P6 137 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 E9PI62 339 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF750Q32MQ0 723 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A6Q92536 515 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GABARAPL3Q9BY60 117 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GON4LQ3T8J9 2241 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 IHHQ14623 411 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 MBOAT4Q96T53 435 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ELK1P19419 428 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SSR4P51571 173 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP21Q9H596 190 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 KLK8O60259 260 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 THBS1P07996 1170 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC36A2Q495M3 483 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OVCH1Q7RTY7 1134 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TEAD3Q99594 435 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 FGF21Q9NSA1 209 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SERTAD4Q9NUC0 356 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HAO2Q9NYQ3 351 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM221A6NGB7 291 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 A6NL46 340 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY10O00398 339 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF195O14628 629 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF10CO14798 259 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-25P01717 112 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SBK2P0C263 348 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 NID1P14543 1247 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CD46P15529 392 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RPS2P15880 293 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ECI1P42126 302 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LIM2P55344 173 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GABREP78334 506 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35B4Q969S0 331 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 BET1O15155 118 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1024LP59773 190 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GLYATL3Q5SZD4 288 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD5Q99666 1765 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PIP5K1CO60331 668 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RPS10P46783 165 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PPT1P50897 306 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 AADACL3Q5VUY0 350 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RDH10Q8IZV5 341 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf49Q96BT1 292 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC6O43699 453 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 KCNIP4Q6PIL6 250 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A6EQ96DS6 147 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PRR14Q9BWN1 585 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SPHK1Q9NYA1 384 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR52A1Q9UKL2 312 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 KITLGP21583 273 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CCR6P51684 374 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ESCO2Q56NI9 601 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 MDGA2Q7Z553 956 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CHRM2P08172 466 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF728P0DKX0 622 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DPP4P27487 766 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RAB5CP51148 216 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK2BQ13554 666 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PDFQ9HBH1 243 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2KP61086 200 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 IKZF1Q13422 519 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms