RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SEC13P55735 322 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GPR18Q14330 331 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GSG1LQ6UXU4 331 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 STPG2Q8N412 459 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 EXD3Q8N9H8 876 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 FXYD6Q9H0Q3 95 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 A6NCN8 305 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 F5H5P2 479 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 H0Y8X5 98 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 H0YC42 278 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GOSR2O14653 212 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RLN1P04808 185 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 APODP05090 189 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 AQP2P41181 271 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PRPS1P60891 318 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 NPSR1Q6W5P4 371 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 BVESQ8NE79 360 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C3orf49Q96BT1 292 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 VSTM2LQ96N03 204 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 B3GNT4Q9C0J1 378 aa13.58□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 TSPAN9O75954 239 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 TPPPO94811 219 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 RAB38P57729 211 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ZNF273Q14593 569 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 FAM122BQ7Z309 247 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 JAZF1Q86VZ6 243 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR10AC1Q8NH08 325 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR1S1Q8NH92 325 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 MED11Q9P086 117 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 LRIT1Q9P2V4 623 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 EFCAB7A8K855 629 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 RDH16O75452 317 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CSTAP01040 98 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 PGDP52209 483 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 EFNB2P52799 333 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 SLC25A1P53007 311 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 GUCA2AQ02747 115 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 MELKQ14680 651 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 NNATQ16517 81 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ZNF595Q8IYB9 648 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 FAM131CQ96AQ9 280 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 SPACA7Q96KW9 195 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OBP2AQ9NY56 170 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 H3BSH0 61 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 DCTN6O00399 190 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 HCRTR1O43613 425 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CSF1P09603 554 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 MAZP56270 477 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 RNF44Q7L0R7 432 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CDC20BQ86Y33 519 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR4C3Q8NH37 302 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 OR8K3Q8NH51 312 aa13.57□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 LINC01553A4QN01 128 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 GGT3PA6NGU5 568 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 SERINC4A6NH21 518 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 TVP23AA6NH52 213 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CTAG2O75638 210 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 RASGRP1O95267 797 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 NFATC4Q14934 902 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 BIVMQ86UB2 503 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 CDH26Q8IXH8 852 aa13.56□□□□□ -0.24
SYP-201ENST00000263233 LRRC75AQ8NAA5 344 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms