RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42EP2O14613 210 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 PDGFAP04085 211 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP2Q05923 314 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR2AQ5JU69 321 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM99Q8N816 258 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35A4Q96G79 324 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 GSG1Q2KHT4 349 aa23.88■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 IL20RBQ6UXL0 311 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SIAH3Q8IW03 269 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 NACC2Q96BF6 587 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ART5Q96L15 291 aa23.87■■□□□ 1.41
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