RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacng2O88602 323 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01637 128 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HexaP29416 528 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tacr1P30548 407 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TesP47226 423 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr1fQ02284 366 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb41Q30KP6 65 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Laptm5Q61168 261 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex261Q62302 196 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kyat3Q71RI9 455 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgp1Q8BHT7 391 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r3bQ8C767 284 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnka2ipQ8CH19 720 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr1Q8K087 353 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tor2aQ8R1J9 321 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd177Q8R2S8 817 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WacQ924H7 646 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl8a9Q9CQ58 241 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Steap1Q9CWR7 339 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd1Q9DC37 464 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem27Q9ESG4 222 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isg20Q9JL16 300 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celsr3Q91ZI0 3301 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrta2A2A9A2 531 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr294F7CWV4 335 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a7O70451 484 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P03976 113 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LhcgrP30730 700 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxa1P35582 468 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TtlP38585 377 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc12a3P59158 1002 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TsxP70675 144 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs16P97428 201 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam219bQ14DQ1 197 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm648Q3UJ22 213 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IppkQ6P1C1 489 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a7Q6PGE7 637 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult2a8Q8BGL3 282 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankmy1Q8C0W1 906 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpne1Q8C166 536 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc24a5Q8C261 501 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc1a7Q8JZR4 559 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mnd1Q8K396 205 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a8Q8R4D1 576 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr63Q8VBW9 316 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hyal3Q8VEI3 412 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1048Q8VGS2 320 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uxs1Q91XL3 420 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat4cQ9D306 478 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fank1Q9DAM9 344 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgfrnQ9WV91 879 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyofQ69ZN7 2048 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YD13 301 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp978A2A7I1 335 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp442A2AQA0 667 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cisd3B1AR13 137 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Omt2aF6ZJR3 104 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spsb2O88838 264 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcn2O88968 430 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apoa2P09813 102 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp1P12710 127 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr6P34986 316 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St3gal3P97325 374 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk8Q61955 260 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frg2f1Q6P3A2 227 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkzQ80UP3 929 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9130023H24RikQ8BG98 337 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcc2Q8BK67 520 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baiap2Q8BKX1 535 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf574Q8BY46 900 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem17Q8K0U3 198 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt18Q8K1B9 622 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lyrm4Q8K215 91 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc36Q8VBW8 186 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtm3Q99LJ5 184 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc19a3Q99PL8 488 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem186Q9CR76 216 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kti12Q9D1R2 351 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nox4Q9JHI8 578 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamdec1Q9R0X2 467 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pmm2Q9Z2M7 242 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa11.58□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcnx3Q8VI59 2028 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv6-32A0A140T8N9 115 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10112D3YWP5 117 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amd2D3Z6H8 334 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8159E9Q0R1 267 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21833J3QPK1 500 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EdaO54693 391 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4a10O88833 509 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms