RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT2P36268 569 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OMPP47874 163 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK2BP67870 215 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1RL1Q01638 556 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SKP2Q13309 424 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 APOOLQ6UXV4 268 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 FADS6Q8N9I5 356 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA3Q8NHX4 192 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MED18Q9BUE0 208 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf10Q9HB07 376 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GWA3 101 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A20A6NK97 555 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF2P01344 180 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP4P27487 766 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PTH2RP49190 550 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 COPZ1P61923 177 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf204Q6ZNR8 217 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CTPS2Q9NRF8 586 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 DKKL1Q9UK85 242 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM5Q9Y2B1 443 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZAR1LA6NP61 321 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 THBDP07204 575 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LINGO3P0C6S8 592 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PAX1P15863 534 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CTBP2P56545 445 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CD47Q08722 323 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CD226Q15762 336 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A2Q6IF42 318 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM239Q8WW34 195 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF566Q969W8 418 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RTN4RQ9BZR6 473 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF122Q9H9V4 155 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOVL5Q9NYP7 299 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFB5O43674 189 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MPZL2O60487 215 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM11O75078 769 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC159P0C7I6 412 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 POU2F1P14859 743 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA2P29317 976 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA4AP68366 448 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRPAP78324 504 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCDQ05655 676 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 WBP2NLQ6ICG8 309 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 P4HA3Q7Z4N8 544 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF610Q8N9Z0 462 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENONQ9NZV5 590 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf97H3BN30 126 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CD8BP10966 210 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMTP11086 282 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK5R2Q13319 367 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 UBQLNLQ8IYU4 475 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK20Q8IZL9 346 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF786Q8N393 782 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2M3Q8NG83 312 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOXF1Q8NHV9 184 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MED31Q9Y3C7 131 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53P04637 393 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PEPDP12955 493 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 EVI2BP34910 448 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG10BQ5I7T1 473 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SLX4IPQ5VYV7 408 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC9Q8TBE3 224 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GPA33Q99795 319 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ICAM5Q9UMF0 924 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF337Q9Y3M9 751 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WUJ7 227 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPTL1O95841 491 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN20P56880 219 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42P60953 191 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf67Q0P5P2 114 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 NRMQ8IXM6 262 aa21.42■■□□□ 1.02
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