RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PDK3Q15120 406 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ALG10Q5BKT4 473 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BICRALQ6AI39 1079 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM225Q6GV28 225 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR2A2Q6IF42 318 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GID4Q8IVV7 300 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 LNX2Q8N448 690 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AMER2Q8N7J2 671 aa6.58□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF570Q96NI8 536 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OXGR1Q96P68 337 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR5B2Q96R09 309 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IFT27Q9BW83 186 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CHST11Q9NPF2 352 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 INIPQ9NRY2 104 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 VNN3Q9NY84 501 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF175Q9Y473 711 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF726A6NNF4 738 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ADAM10O14672 748 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RNF13O43567 381 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TXNDC12O95881 172 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RENP00797 406 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 THY1P04216 161 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 CPEP16870 476 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 SDHAP31040 664 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PCYT1AP49585 367 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DIO1P49895 249 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CASP6P55212 293 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GFRA1P56159 465 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR2B6P58173 313 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GPR85P60893 370 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 ITGADQ13349 1161 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GINS1Q14691 196 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SNAPC1Q16533 368 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF691Q5VV52 312 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A19Q695T7 634 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 HBMQ6B0K9 141 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 VASNQ6EMK4 673 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MZT2AQ6P582 158 aa6.57□□□□□ -1.36
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SMAD4-210ENST00000590061 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 UEVLDQ8IX04 471 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GHDCQ8N2G8 530 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 EXD3Q8N9H8 876 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR51A7Q8NH64 312 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TAAR8Q969N4 342 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.57□□□□□ -1.36
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