RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA2P17301 1181 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V1B2P21281 511 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MPGP29372 298 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 BIDP55957 195 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKCDQ05655 676 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 BNIP1Q12981 228 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MELKQ14680 651 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PPA1Q15181 289 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 FXNQ16595 210 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 FGD3Q5JSP0 725 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LINGO2Q7L985 606 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 NRMQ8IXM6 262 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR31Q8NA23 367 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR51A7Q8NH64 312 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LRGUKQ96M69 825 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MUS81Q96NY9 551 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2M2Q96R28 347 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10A4Q9H209 315 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR35Q9HC97 309 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 NGBQ9NPG2 151 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A096LPE4 126 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PPR1 153 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PPZ6 126 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PRG6 482 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 DPRXA6NFQ7 191 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5H1A6NKK0 313 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PDLIM1O00151 329 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMG1P04279 462 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 COX5AP20674 150 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 RRM2P31350 389 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR4P46093 362 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF83P51522 516 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM11AP58511 58 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CTXN1P60606 82 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CBX1P83916 185 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 MYBPC1Q00872 1141 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SPIBQ01892 262 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TGFBR3Q03167 851 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNB3Q05901 458 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC23BQ15437 767 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 BEX5Q5H9J7 111 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OAFQ86UD1 273 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM123Q8N131 208 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LIPHQ8WWY8 451 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP5K1AQ99755 562 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CRLF2Q9HC73 371 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-211ENST00000588374 IL1RAPQ9NPH3 570 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms